Episodio 1
Ritorno
I tuttofare Yun e Haberu indagano su alcuni suoni provenienti da una villa abbandonata e scoprono la fonte nelle vicinanze. Nel frattempo Mei sente la stessa musica.
Episodio 2
Attacco
Yun, Goro e il robot Jet Jaguar si scontrano con Rodan, un ostile kaiju simile a uno pterosauro. Mei si reca a Tokyo per incontrare una ricercatrice di fama mondiale.
Episodio 3
Ferocia
Una legione di Rodan si avvicina a Nigashio. La squadra della fabbrica Otaki fa di tutto per attirarli via dalla città, ma si trova presto circondata.
Episodio 4
Viaggio
Yun e Haberu deducono che Misakioku potrebbe essere collegato all'invasione di Rodan. Mei partecipa a una lezione a Dubai, dove la prof.ssa Li rivela nuovo materiale.
Episodio 5
Predizione
Salunga emerge dalle profondità del centro ricerche di Upala ricoperto di polvere rossa. Altrove Yun osserva l'incredibile abilità dimostrata da Anguirus.
Episodio 6
Mistero
Mei scopre un codice misterioso nella ricerca del professor Ashihara. La squadra Otaki partecipa agli sforzi di sterminio della città e affronta Anguirus.
Episodio 7
Distorsione temporale
Un kaiju gigante atterra a Tokyo seguendo un gruppo di Manda. Il volo verso Londra di Mei e della prof.ssa Li è dirottato su Milano dalla polvere rossa.
Episodio 8
Indizio
Forze di terra sotto il comando di Matsubara rispondono all'attacco di Godzilla contro Tokyo. Giunta a Londra, Mei cerca di decifrare la ricerca di Ashihara.
Episodio 9
Morte
Godzilla continua ad avanzare su Tokyo e copre la città di polvere rossa. La squadra Otaki si precipita a salvare una persona intrappolata da un kaiju simile a un ragno.
Episodio 10
Codifica
Di ritorno alla villa di Ashihara, Yun e Haberu tentano di decifrare la ricerca del professore utilizzando Jet Jaguar. In India, Lina porta Mei a incontrare BB.
Episodio 11
Rilancio
Prima di andare al Computer Sovratemporale, BB mostra a Mei il Punto di singolarità. La squadra Otaki parte per Tokyo per distruggere Godzilla.
Episodio 12
Battaglia
Mei scopre che una grande esplosione è stata causata anni fa dal computer di Ashihara. Kanoko dà a Matsubara il diagonalizzatore ortogonale da usare contro Godzilla.
Episodio 13
Insieme
Mei, BB e Pelo 2 tentano di evitare la catastrofe, ma Salunga tende loro un'imboscata. Nel frattempo, la squadra Otaki sferra l'attacco finale a Godzilla.
