Episodio 1
La confraternita
Il nerd amico di liceo di Peter Parker, Max, è coinvolto in uno scherzo mortale della confraternita che lo trasforma in Electro, un fallito supercriminale dotato di poteri ad alto voltaggio che minaccia il campus. Solo Spider-Man può impedirgli di vendicarsi degli studenti e, per salvare sia Max che il campus, ucciderà il povero Electro che finisce in corto circuito.
Episodio 2
Episodio 2
La maestra di arti marziali e spadaccina Shikata viene inviata a catturare Spider-Man per la collezione di animali rari di un uomo ricco. Shikata pensa che Spider-Man sia un nemico troppo nobile per essere semplicemente catturato e devono combattere fino alla morte. A questo punto, Spider-Man e Shikata devono salvare la collezione di animali rari e sconfiggere il cattiv'uomo.
Episodio 3
La legge della giungla
Il professore di Peter, il dottor Curt Connors, si inietta del DNA rettiliano, che lo trasforma lentamente nell'orrendo e vendicativo Lizard. Mentre il siero colpisce il cervello di Connors, Spider-Man deve fermare il suo amato professore mentre inizia a cercare vendetta su coloro che gli hanno fatto del male, incluso Harry Osborn. Inoltre Spider-Man e Harry devono salvare il professor Connors dalle grinfie di Lizard.
Episodio 4
Segreti in amore
Spider-Man vuole catturare Talon, una ladra responsabile di una serie di rapine ad alto rischio in città. Le cose si complicano quando Spidey scopre la vera identità di Talon, ovvero la nuova ragazza del suo migliore amico Harry. Spider-Man, allora, deve fare in modo che Harry licenziasse Talon dall'incarico di ladra e che i due dovranno tornare a stare insieme.
Episodio 5
Preso in ostaggio
Tre ex agenti del KGB, ora una squadra di mercenari chiamata Pterodax, prendono in ostaggio un gruppo di persone, tra cui Peter e la sua nuova cotta, Indy. La loro richiesta è semplice, vogliono Spider-Man. Peter dovrà usare la sua astuzia e intelligenza per trovare un modo per placare i Pterodax senza rivelare il suo alter-ego.
Episodio 6
Pazza d'amore
La compagna di laboratorio di Peter Parker, Christina, gli legge nel pensiero con la sua nuova invenzione, una corona ESP. La corona funziona male, scuotendo il suo cervello con l'elettricità e alterando la sua sanità mentale. Non essendo più in grado di distinguere la realtà dalla fantasia, Christina tenta di uccidere M.J. per limitare la competizione per l'eterno amore che prova nei confronti di Spider-Man. Ma Peter, per salvare Mary Jane da un maledetto attentato alla vita di Christina, deve provare a funzionare bene la corona.
Episodio 7
Scontro ad alta tensione
Electro ritorna dalla sua apparente morte e cerca di far diventare Sally, una ragazza di cui ha una cotta, un essere elettrico proprio come lui. Peter, allora, dovrà salvare Sally e uccidere l'odiato Electro che finisce in corto circuito per la seconda volta.
Episodio 8
Intrigo internazionale
Peter si presenta a una conferenza stampa e inavvertitamente registra prove incriminanti contro Silver Sable, una criminale fallita su commissione dell'Europa orientale. La malefica assassina è pronta a tutto pur di riavere indietro il nastro, arrivando anche a minacciare di uccidere Mary Jane, Harry e Indy, così Spidey dovrà fermarla ad ogni costo, affinché registrerà il nuovissimo nastro contro l'ormai povera ex attentatrice che viene arrestata dalla polizia, dichiarata colpevole dal giudice del tribunale, ma picchiata e uccisa dai duri e furibondi carcerieri di una durissima e corrotta prigione, dopo essere stata minacciata di morte dagli studenti, furiosi per le sue crudeli azioni dopo che Spider-Man ha salvato la vita di Harry, Indy e Mary Jane.
Episodio 9
Inganno internazionale
Spider-Man viene ingannato dal famigerato signore del crimine Kingpin per rubare il superchip TX-1, progettato per decifrare le trasmissioni satellitari riservate che guidano i mercati finanziari mondiali. Per rimediare all'errore deve trovare un modo per riaverlo e Spider-Man dovrà contro-ingannare Kingpin per restituire il superchip TX-1 ai mercati finanziari mondiali.
Episodio 10
Il polo scientifico
Spider-Man combatte Turbo Jet, un moderno Robin Hood armato di un sistema di propulsione fatto in casa, che ruba ai ricchi e dona ai poveri. La vita di Spidey diventa ancora più difficile mentre il pubblico si raduna intorno a Turbo Jet e contro Spider-Man. Allora Spider-Man progettò un piano per fare in modo che il pubblico si radunasse contro Turbo Jet che viene sconfitto, catturato e smascherato dalla polizia che lo arresta.
Episodio 11
Genio e ingegno
Il dottor Zellner testa la sua "droga intelligente" sul nemico di Peter Parker, Flash Thompson, e Flash mostra immediatamente picchi drammatici nell'intelletto. Tuttavia, insieme all'aumento del suo QI arriva un effetto collaterale potenzialmente fatale. Con solo pochi minuti per trovare un antidoto, Zellner accetta il suggerimento di Flash di sperimentare su un candidato già intelligente, Peter Parker. Spider-Man dovrà salvare la situazione per creare un antidoto tutto nuovo e sempre intelligente usato come prova contro Zellner che viene finito in manette dalla polizia e Flash viene rimbrottato dalla vicepreside dell'Empire State University che lo sospende fino al 15º giorno.
Episodio 12
Giochi telepatici (prima parte)
I Gemelli Gaines, un fratello e una sorella dotati di incredibili poteri di telepatia, fuggono da un convoglio blindato, ma Spider-Man li cattura superando le loro esplosioni cerebrali con la sua stessa forza di volontà sovrumana. Più tardi, proprio mentre Spider-Man rivela a MJ di essere davvero Peter Parker, Kraven il cacciatore affronta Spider-Man e per vendicarsi per gli anni trascorsi in prigione, il nemico attacca MJ con uno dei suoi dardi avvelenati. Spider-Man si precipita ad aiutare la ragazza ma ciò si rivela vano, e decide di stare con lei fino a quando MJ non perde la vita. Ora, Peter è in cerca di vendetta.
Episodio 13
Giochi telepatici (seconda parte)
Spider-Man si rende conto che i diabolici Gemelli Gaines hanno usato i loro poteri telepatici per fargli credere che MJ sia morta per mano di Kraven. Così mette all'angolo i gemelli, ma le cose prendono una brutta piega quando usano ancora una volta la loro telepatia per ingannarlo e questa volta vede Indy gravemente ferito. Il senso di colpa fa sì che Peter metta il suo costume all'interno di una valigia piena di sassi e lo getti in fondo al porto, abbandonando la sua carriera di combattente del crimine.
