Episodio 1
Doremì apprendista strega
Doremì, una bambina delle elementari, scopre che Eufonia (Majo Rika), la proprietaria del negozio di articoli magici MAHO, è una strega. A causa di un incantesimo, secondo cui ogni strega che viene riconosciuta da un essere umano viene trasformata automaticamente in una ranocchia, Eufonia, diventata la rana Raganella, comincia a istruire Doremì fino a farle sostenere l'esame finale che la renderà una strega, in grado di farle riassumere il suo vero aspetto.
Episodio 2
Scambio di ruoli
Doremì e la sua amica Melody (Hazuki Fujiwara) vogliono vivere l'una la vita dell'altra per un giorno. Doremì, ormai diventata apprendista strega, utilizza la magia per fare ciò, ma questo porta ad alcune conseguenze.
Episodio 3
Una nuova compagna di classe
Una nuova ragazza di nome Sinfony (Aiko Senoo) arriva nella classe di Doremì e Melody, che rimangono stupite dalla sua allegria, ma con cui fanno subito amicizia.
Episodio 4
Tre amiche e un negozio
Melody e Sinfony scoprono che Doremì può usare la magia: essendo però solo un'apprendista strega, non subisce alcuna trasformazione, ma Raganella è costretta a prendere con sé anche loro, dato che hanno scoperto l'esistenza della magia.
Episodio 5
L'inaugurazione del negozio
Le tre ragazze rimodernano e aprono il negozio di magia, dopo che Doremì l'ha quasi distrutto. Mentre aspettano clienti, annunciata da una canzone fa loro visita Dela, la strega che si occupa dei rifornimenti dei negozi di articoli magici.
Episodio 6
L'amicizia non si fonda sulle bugie
Nobuko Yokokawa è famosa a scuola per raccontare bugie a tutti. Sinfony, che non la conosce ancora, la crede e ci rimane molto male quando capisce che le ha mentito.
Episodio 7
La prova del nono livello
Le tre bambine si preparano a sostenere il loro primo esame da apprendiste, ma Doremì passa il giorno a sorvegliare la sorellina minore Bibì (Pop), che vuole andare a casa dei nonni in treno da sola. Quando arriva il momento della prova, Melody e Sinfony passano all'ottavo livello e ricevono la loro fatina, mentre Doremì fallisce.
Episodio 8
L'esame di riparazione
A Doremì viene data un'altra chance per passare l'esame, in cui dovrà trovare una medicina per Motamota, una delle esaminatrici. Fortunatamente la bambina passa, anche grazie all'aiuto di Melody e Sinfony, e riceve la sua fatina.
Episodio 9
Fatina in fuga
La fatina di Doremì, Dodò, scappa via dopo essere stata sgridata. Le tre bambine utilizzano il loro nuovo incantesimo, il Cerchio Magico (Magical Stage), per trovarla.
Episodio 10
Le foto di un segreto
Attraverso delle foto, la signorina Seki e il vice preside scoprono che Doremì, Melody e Sinfony lavorano in un negozio, andando contro le regole della scuola. Con l'aiuto della magia, le tre spiegano che danno solamente una mano e che la proprietaria è loro parente.
Episodio 11
L'amore per i fiori
Dopo essere stata presa in giro da Takao Kimura, Marina Koizumi, che ama i fiori, si rifiuta di prendersi cura delle aiuole del giardino scolastico. Melody la aiuta e le fa capire che Takao è pentito di quanto successo.
Episodio 12
Un campione in panchina
Un bambino di nome Misaki Shibayama fa vedere a tutti la sua maglietta per fare il tifo al fratello maggiore Daichi nelle partite di calcio.
Episodio 13
L'esame dell'ottavo livello
Le apprendiste svolgono l'esame di ottavo livello, in cui hanno solamente tre ore per superare degli ostacoli, inconsapevolmente scelti in precedenza.
Episodio 14
Se piangi… poi ridi!
Naomi Okuyama viene presa in giro dal trio SOS per aver messo in mostra il suo lato femminile e si rifiuta di perdonarli, fino a quando non la fanno sorridere.
Episodio 15
Raganella all'asilo
Raganella viene presa da Bibì, che la tratta come un peluche chiamandola Spumella e la porta con sé all'asilo.
Episodio 16
Come pescare l'amore
Il padre di Doremì porta lei e le sue amiche a una battuta di pesca con un giovane ragazzo che condivide la sua passione.
Episodio 17
Un ragazzo difficile
Si diffonde la voce che Masaru Yada sia coinvolto in grossi guai e nessuno oltre alla signorina Seki e Melody crede non abbia fatto nulla. Doremì e le altre utilizzano la magia per scoprire se le voci che stanno dietro a lui sono vere.
Episodio 18
Magia proibita
Dopo un colpo di fortuna che permette loro di passare il settimo livello, le tre apprendiste utilizzano la magia per capire il rifiuto verso i coniglietti di Nanako Okada: scoprono, infatti, che la bambina una volta ha perso un cagnolino e ha paura di affezionarsi a un altro animale domestico, perché pensa potrebbe succedere la stessa cosa.
Episodio 19
Il denaro non è tutto
Per aver infranto le leggi del Mondo delle Streghe, Melody viene privata dell'uso della magia. Tuttavia, l'ultimo giorno della punizione, viene rapita da due imbroglioni e solamente Doremì e Sinfony la possono salvare.
Episodio 20
Spiazzate dalla concorrenza
Raganella perde in un gioco a carte contro Dela, ed è costretta a vendere il negozio alla sua rivale di sempre Malissa (Majo Ruka).
Episodio 21
Talismani con sorpresa
Dopo aver notato che le persone intorno a loro sono sempre malate per via dei talismani magici di Malissa, Doremì e le altre usano la magia per spezzare l'incantesimo.
Episodio 22
Negatività
Senza il negozio di magia, le bambine non hanno vie d'accesso per il Mondo delle Streghe e, di conseguenza, non possono sostenere l'esame di sesto livello.
Episodio 23
L'armonica nuova
Dopo che il padre regala a Sinfony una nuova armonica dicendo di buttare via la vecchia, a cui Sinfony è affezionata, la ragazza si arrabbia e scappa a casa di Melody. Lì trovano un modo per andare nel mondo magico e sostenere l'esame.
Episodio 24
Una sfida accesissima
Con le loro nuove bacchette, gli Ultramusichieri (Couleur Poron), le tre apprendiste vincono la sfida contro Malissa sul controllo del negozio di magia MAHO.
Episodio 25
Piccola, vivace streghetta
Bibì, avendo visto sua sorella e le amiche usare la magia, diventa un'apprendista strega. Con i suoi nuovi poteri, crea il panico al pigiama party dell'asilo con dei fantasmi, ma Doremì, Sinfony e Melody risolvono la situazione.
Episodio 26
Il gatto soriano
La famiglia di Kanae Iida gestisce un ristorante di bistecche. Doremì e le altre scoprono che il locale è pieno di energia negativa e cercano di capire il perché. La Regina delle Streghe, intanto, le nomina Sentinelle (Pureleine), il cui compito, avendo un cuore puro, è catturare le Figure Nere.
Episodio 27
Le Sentinelle in azione!
Le apprendiste ricevono un computer magico (Purelein Personal Computer), in cui porre tutte le Figure Nere che catturano. Inoltre, fanno la conoscenza di Alexander, mago imprigionato all'interno dell'apparecchio che ha lasciato scappare le carte.
Episodio 28
Scintille d'amore sul campo da tennis
Doremì s'innamora di Yutaka, un giocatore di tennis, ma anche la sua compagna di classe Reika Tamaki ha messo gli occhi sul ragazzo.
Episodio 29
Guardia e ladro
Doremì perde accidentalmente il suo Jingle Set (Minarai Tap) alla fiera del festival estivo.
Episodio 30
Il fantasma
Doremì, Melody, Sinfony e i loro compagni di classe vanno al tempio della famiglia di Nobuaki Yamauchi per raccontare storie dell'orrore sui fantasmi e testare il loro coraggio.
Episodio 31
Un regalo speciale
Dopo il ritorno dalle vacanze estive, le ragazze si interessano al racconto del viaggio fatto in Mongolia dalla loro compagna di classe Shino Hanada. Nel frattempo devono anche sostenere l'esame di quinto livello.
Episodio 32
Le elezioni del rappresentante di classe
Masaharu Miyamoto, con il supporto di Doremì e le sue amiche, sfida Reika Tamaki nelle elezioni del rappresentante di classe.
Episodio 33
Follie allo stadio
A scuola si tiene l'annuale incontro di atletica, ma una serie di inconvenienti comincia ad affliggere l'evento.
Episodio 34
L'incontro mancato
La madre di Sinfony arriva in città per vedere la figlia, ma non riesce ad affrontarla e guardarla in faccia per averla lasciata a causa del lavoro. Dopo aver scoperto che sua madre è venuta a farle visita senza poi vederla, Sinfony con Doremì e Melody va a Osaka in sella alla sua scopa magica per incontrarla.
Episodio 35
La nuova compagna di scuola
La famosa idol e attrice Lullaby (Onpu Segawa) diventa compagna di classe di Doremì e le altre, le quali scoprono che anche lei è un'apprendista strega sotto l'istruzione di Malissa.
Episodio 36
L'esame del quarto livello
Per superare l'esame di quarto livello, le apprendiste devono fare una gara di corsa in un percorso pieno di ostacoli contro la lepre e la tartaruga più veloci del Mondo delle Streghe.
Episodio 37
La visita delle ranocchie
Una violenta tempesta colpisce il Mondo delle Streghe, facendo cadere nel mondo umano un gruppo di streghe-ranocchie. Le apprendiste devono trovare una soluzione per farle ritornare indietro, prima che qualcuno le scopra.
Episodio 38
Passione… mostruosa
Ryota Hayashi ha una grande passione per i mostri, in particolare Gazamadon, e tutti lo prendono in giro per questo. Stanco di ciò, butta tutti i suoi giocattoli. Con l'aiuto del Cerchio Magico, Doremì, Melody e Sinfony fanno ricredere il ragazzo.
Episodio 39
Un amore magico
Il fratello che va alle medie di Maki Higuchi, Shuzo, vede Lullaby in divisa d'apprendista. Per non farsi scoprire, la ragazza usa la magia per distrarlo e farlo innamorare della prima persona che vede. La persona in questione si rivela essere Doremì.
Episodio 40
L'Albero delle Note Magiche
Per superare l'esame di terzo livello e ricevere così una piantina che quando germoglia produce un sacco di Note Magiche, le apprendiste devono trovare e attraversare una porta magica entro un'ora di tempo. L'esame, inoltre, devono sostenerlo da sole separatamente, contando sulle loro sole forze e, nel caso, ricorrendo alla magia solamente due volte.
Episodio 41
Scacchi stregati
Shota Taniyama ama il gioco dello shōgi e riesce persino a battere il vice preside. Tuttavia, i suoi genitori sono contrari al suo desiderio di giocare. Con l'aiuto della signorina Seki, partecipa a un imminente torneo, arrivando in finale, ma comincia a diventare nervoso a ogni mossa che fa: questo porta Doremì, Melody e Sinfony a identificare la presenza di una Figura Nera.
Episodio 42
Eroi per passione
Kota Amano, un ragazzo con la passione per i supereroi Battle Rangers, viene sfidato a combattere da un senpai, che crede erroneamente stia uscendo con Lullaby.
Episodio 43
Padri e figlie
Reika decide di scappare di casa perché pensa che suo padre non si preoccupi per lei dato che non la sgrida mai. Anche Shiori Nakayama, spesso malata, ha problemi con suo padre.
Episodio 44
Sogni e speranze sul ring
Mutsumi Kudo, la più forte della classe che ama il wrestling, è una fan della lottatrice Candy Itō, ma rimane delusa quando questa annuncia un possibile suo ritiro.
Episodio 45
Dov'è Babbo Natale?
Babbo Natale si ammala e chiede a Doremì e le amiche di distribuire i regali al suo posto.
Episodio 46
Trucchi di magia
Le ragazze aiutano Michiaki Watabe nel suo spettacolo da prestigiatore, visto l'assenza del padre. Intanto, per l'esame di secondo livello, alle apprendiste viene richiesto di intrattenere un gruppo di streghe con giochi di prestigio.
Episodio 47
L'appuntamento
Il capo del padre di Sinfony organizza un appuntamento tra lui e sua figlia Midori per un possibile matrimonio, ma Sinfony non è pronta per una seconda madre.
Episodio 48
Illusioni via internet
Goji Nakata diventa una delle tante vittime di una e-mail inviata per scherzo da Piccolina (Hehe), la fatina di Malissa, in cui si chiedeva un appuntamento con Lullaby.
Episodio 49
Il treno della felicità
Il padre di Lullaby, che Lullaby non vede da sei mesi, è il nuovo conducente di un super treno espresso che si ferma in città. A causa di un'audizione, Lullaby non arriva in tempo per poterlo vedere, ma grazie alla magia di Doremì, Sinfony e Melody, riesce a salire sul treno e vedere così suo padre.
Episodio 50
L'esame finale
Per superare l'esame di primo livello e diventare streghe a tutti gli effetti, le tre bambine devono usare la magia per aiutare qualcuno nel mondo umano e ricevere il loro ringraziamento. Tuttavia le cose si complicano in peggio quando i familiari e amici scoprono il loro segreto.
Episodio 51
Bye bye, magia
Lullaby utilizza la magia per far dimenticare a tutti il loro segreto, ma poiché è proibito viene punita e cade in un sonno profondo lungo cento anni. Per poterla risvegliare, Doremì, Melody e Sinfony devono scegliere se diventare vere streghe oppure salvare la loro amica e, quindi, rinunciare ai poteri magici.
