Episodio 1
Un nuovo inizio
Sei mesi dopo la morte di Sherlock Holmes per mano di Moriarty, John Watson torna a dirigere una clinica per malattie rare, ma il suo passato lo perseguita.
Episodio 2
Giubbe rosse
Watson indaga sul caso di un uomo con un proiettile conficcato in testa e che sembra nascondere qualcosa di losco.
Episodio 3
Aspettando la battuta finale
Watson si occupa di una cabarettista svenuta durante una serata. Nel frattempo, lo stesso Watson perde i sensi e subisce un altro trauma cranico.
Episodio 4
Paziente punto interrogativo
Quando Sasha scopre un legame tra il suo paziente attuale con tumori avanzati e lesioni alla lingua tipiche della sindrome di Cowden, e un cadavere dissezionato durante gli studi di medicina, la squadra segue il caso fino a una comunita' Amish.
Episodio 5
L' uomo con il torace luminoso
Watson si assume un rischio etico quando decide di trattare una paziente affetta da anemia falciforme con un intervento chirurgico non convenzionale, e il team si trova di fronte a un dilemma: voltarsi dall'altra parte o aiutare la giovane donna.
Episodio 6
Il caso della camgirl
Stephens trova il coraggio di chiedere aiuto a Watson quando la sua camgirl sviene durante una videochiamata. Non sa nulla della sua vita reale e il team deve trovare il modo di localizzarla, prima che sia troppo tardi.
Episodio 7
I segni dei denti
Mentre la squadra aiuta una donna con una memoria che si azzera ogni tre minuti, Watson lotta con allucinazioni uditive. E Moriarty pianifica la sua mossa successiva.
Episodio 8
Una variante di significato incerto
Watson incontra Irene Adler, un'abile truffatrice e vecchia conoscenza di Sherlock Holmes.
Episodio 9
Storia familiare
Le bugie di Ingrid le presentano il conto quando sua sorella Gigi deve essere curata dal team per gravi effetti collaterali dovuti a trattamenti segreti.
Episodio 10
L'uomo con la mano aliena
Watson si ritrova coinvolto nel caso di un paziente affetto da sindrome della mano aliena e responsabile di aver spinto il fratello sotto un autobus.
Episodio 11
La rivelazione del giorno nero
Watson deve affrontare un evento traumatico che risale al suo passato nell'esercito: la moglie di un suo ex commilitone lo contatta per chiedergli aiuto.
Episodio 12
Il lavoro di una vita - 1a parte
Watson annuncia un nuovo ambizioso progetto a cui sta lavorando, mentre parte della squadra si ammala dopo essere stata presa di mira da un complotto.
Episodio 13
Il lavoro di una vita - 2a parte
La squadra deve decidere chi salvare tra i gemelli. Nel frattempo, Shinwell cerca di dare una mano, e Watson affronta Moriarty.
