Episodio 1
L'apprendista
La detective Jane Rizzoli e la dottoressa Maura Isles lavorano insieme sul caso dell'omicidio di una coppia di benestanti le cui caratteristiche fanno pensare al serial killer chiamato 'il Chirurgo', che al momento però si trova in prigione.
Episodio 2
Lo strangolatore di Boston
Jane ha un confronto con il suo nuovo capo durante le indagini su un possibile imitatore dello Strangolatore di Boston.
Episodio 3
Un esorcismo per Mathias
Jane e Maura indagano sulla morte misteriosa di un ragazzo che potrebbe essere il risultato di un tentativo di esorcismo. Intanto la madre di Maura le combina un appuntamento a sorpresa.
Episodio 4
Non per amore ma per denaro
Angela ha un litigio con suo marito per via dell'auto. Una studentessa viene uccisa in pieno giorno da colpi da arma da fuoco e durante le indagini vengono fuori i suoi segreti.
Episodio 5
Il denaro non basta
Un membro della famiglia Brahmin di Boston rimane vittima di quello che sembra un incidente di vela. Maura e Jane indagano, ma tra di loro si crea attrito per via della famiglia della vittima. Intanto Angela cerca di sponsorizzare una bevanda salutista.
Episodio 6
Omicidio gay
Jane sta lavorando sotto copertura per risolvere il caso di una donna uccisa dopo aver lasciato un bar gay. Maura decide di fare da cupido e presenta a Jane un istruttore di Yoga.
Episodio 7
La vendetta
Durante la Maratona di Boston i partecipanti vengono presi di mira da un cecchino. Jane e Maura devono condurre le indagini con la massima discrezione per evitare che si crei il panico in città.
Episodio 8
La sindrome di Stoccolma
Jane lavora su un caso che potrebbe avere a che fare con Charles Hoyt, un serial killer che all'epoca la rapì prima che fosse catturato e condannato. Jane cerca di non lasciarsi prendere dal panico mentre Maura cerca di entrare nella mente del killer.
Episodio 9
La bestia che è in me
Le indagini di Jane su un ladro di identità la portano a contatto con il passato malavitoso di Boston. Dopo aver scoperto delle informazioni sconvolgenti, Maura segue una pista per indagini personali.
Episodio 10
Quando la pistola fa bum bum
L'assassino di un poliziotto sotto copertura prende di mira il distretto, mettendo a rischio le vite di Jane, Maura e Frankie Jr. Intanto Angela e Frank attendono con ansia il ritorno di Tommy che è stato appena rilasciato di prigione.
