Episodio 1
Un caso inquietante (1ª parte)
Il tenente Harmon Rabb e il suo partner, il sottotenente Caitlin "Kate" Pike, indagano a bordo della USS Seahawk dove una donna, pilota di F-14 Tomcat, viene gettata fuori bordo. I membri del JAG devono scoprire chi l'ha uccisa.
Episodio 2
Un caso inquietante (2ª parte)
Il tenente Harmon Rabb e il suo partner, il sottotenente Caitlin "Kate" Pike, indagano a bordo della USS Seahawk dove una donna, pilota di F-14 Tomcat, viene gettata fuori bordo. I membri del JAG devono scoprire chi l'ha uccisa.
Episodio 3
Ombra
Harm viene inviato a bordo di un sottomarino con il suo nuovo partner, il tenente Megan Austin, dove devono evitare che un siluro colpisca una nave civile.
Episodio 4
Il figlio dell'eroe
Harm e Meg devono scoprire se il figlio di un ex comandante dei Marine ha ferito alcuni suoi compagni durante un'esercitazione.
Episodio 5
Morte ad Arlington
Harm e Meg indagano su alcuni omicidi avvenuti al cimitero nazionale di Arlington mentre il passato di Harm torna a perseguitarlo.
Episodio 6
Errore umano
Un pilota della marina statunitense piuttosto spericolato muore perché dopo aver intrapreso un volo rovesciato si schianta con il suo aerero dotato di un dispositivo di guida automatica. Nonostante la fama del pilota, suo carissimo amico, Harmon, che sta indagando, contro il parere di tutti sospetta un difetto nell'automatismo e non un errore umano. La situazione si complica quando appare che il defunto avesse una relazione extraconiugale con una collega, rimasta tra l'altro incinta in passato.
Episodio 7
Urla di guerra
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Episodio 8
L'evasione
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Episodio 9
Scimitar
Un marine viene fatto prigioniero in Iraq durante la dittatura di Saddam Hussein per aver sconfinato erroneamente. Viene rinviato a giudizio per spionaggio e su invito dell'Iraq la marina manda come difensori Harm e Mac ad affrontare un processo farsa. In realtà la missione di Harm è recuperare il prigioniero e fuggire con il supporto dei Navy SEAL e l'aiuto di un misterioso e sconosciuto doppiogiochista iracheno
Episodio 10
Suicidio a Parris Island
Una recluta marine donna muore impiccata alla corda di un muro di allenamento nel campo di addestramento. Harm si reca sul posto in via ufficiale mentre Meg si traveste da recluta per indagare sotto copertura. Anche se in apparenza sempra un incidente si comprende che si tratta di un suicidio o di un omicidio e i sospetti cadono sulle due istruttrici estremamente severe. Anche il comandante della base ha un atteggiamento omertoso.
Episodio 11
Avvistamenti
Una bambina viene rapita. In apparenza sembrano siano stati degli alieni. La presenza di una base militare abbandonata alimenta il mistero.
Episodio 12
Fratellanza
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Episodio 13
Azione difensiva
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Episodio 14
Sigari cubani
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Episodio 15
Hemlock
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Episodio 16
Posizione di vantaggio
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Episodio 17
Operazioni speciali
Il figlio di una senatrice, un pilota di marina muore durante un addestramento con i Navy SEAL. Harm e Meg si trovano a gestire un'indagine difficile tra la madre che grazie al suo potere incalza gli inquirenti, non nascondendo il suo disprezzo per la vita militare e le scelte del figlio, ed i seal che nascondono la verità.
Episodio 18
Superstiti
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Episodio 19
Sabotaggio spaziale
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Episodio 20
Il prigioniero
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Episodio 21
Ares, il dio della guerra
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Episodio 22
Accusato
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