Episodio 1
Benvenuti nella Scuola della Disperazione
Makoto Naegi si ritrova suo malgrado a partecipare a un gioco terribile che coinvolge altri 14 studenti durante il suo primo giorno nell'elitaria Hope’s Peak Academy.
Episodio 2
Libero di uccidere o sopravvivere
Gli studenti cercano di adeguarsi al nuovo stile di vita: "uccidi o vieni ucciso" imposto da Monokuma. Una spaventata Sayaka si presenta da Makoto.
Episodio 3
L’Arco non normale
Durante il processo di classe, il principale indiziato è Makoto, e un intervento inatteso lo salva mentre cerca disperatamente di dimostrare la propria innocenza.
Episodio 4
(A)normale Arco di Vita: Rivista Settimanale Shonen della Disperazione
Il processo rafforza il legame tra gli studenti. Un annoiato Monokuma annuncia un nuovo incentivo se qualcuno non morirà entro 24 ore.
Episodio 5
L’Anormale Arco: Rivista Settimanale Shonen della Disperazione
Ha inizio il secondo processo di classe per l'omicidio di Chihiro Fujisaki. Riuscirà Makoto a scoprire l'identità del vero assassino?
Episodio 6
Ritorna la leggenda galattica! Sorgi, eroe corazzato! (1)
Sono rimasti solo 10 studenti e Monokuma offre un generoso premio in denaro a chi riuscirà a diplomarsi. Aoi afferma di aver visto il fantasma di una delle vittime.
Episodio 7
Ritorna la leggenda galattica! Sorgi, eroe corazzato! (2)
Il terzo processo ha inizio. Yasuhiro è l'indiziato principale anche se sostiene di essere stato intrappolato in un armadietto per tutta la notte precedente.
Episodio 8
Tutte tutte scuse (1)
Sakura è accusata di fare il doppio gioco. La I.A. rimasta nel computer di Chihiro svela informazioni preziose su un particolare incidente.
Episodio 9
Tutte tutte scuse (2)
Dopo il ritrovamento di un cadavere, il quarto processo ha inizio. Gli indiziati sono tre, ma i loro racconti complicano le cose.
Episodio 10
Cibo spazzatura... (1)
Quando l'ultimo piano viene riaperto, gli studenti trovano una classe che sembra essere stata teatro di un massacro terribile.
Episodio 11
Cibo spazzatura... (2)
Gli studenti sono sconvolti nel rivedersi in TV, ma il processo per la morte della misteriosa sedicesima vittima ben presto ha inizio.
Episodio 12
Il motivo per cui...
Monokuma fa un annuncio e sblocca tutte le stanze. Gli studenti proseguono con le indagini e scoprono la sconvolgente verità.
Episodio 13
Addio, Scuola della Disperazione
La vera identità della mente responsabile di tutto viene svelata. Ottenute le risposte che voleva, Makoto deve prendere una decisione finale.
