Episodio 1
La maledizione di Cleopatra: Parte I e II
Durante un'importante scoperta, riguardo le tombe di Cleopatra e Marco Antonio, la dottoressa Castillo viene rapita da un gruppo di terroristi. Danny decide, quindi, di reclutare Lexi, anche se lei lo ha sempre incolpato per la morte del padre, per andare in suo aiuto. 1942. Alcuni soldati tedeschi rimangono misteriosamente intrappolati nella tomba di Cleopatra. Nel frattempo, ai giorni nostri, Shaw continua la sua fuga oltre il confine e trova un acquirente disposto ad acquistare i manufatti: Farouk.
Episodio 2
Il codice di Hawaladar
Un ufficiale dei servizi segreti, che Danny conosce da tempo, è sospettato di essere un affiliato di Farouk e, per attirarlo a Parigi, Danny si spaccia per Shaw, ma il terrorista viene salvato da Gwen.
Episodio 3
Il segreto di Macho Grande
Nel ’44, i nazisti spostano Cleopatra in un rifugio segreto a causa dei bombardamenti. La Karlsson cerca la talpa di Farouk , mentre Danny intuisce che il terrorista si trova in Germania, per via di un castello.
Episodio 4
La fratellanza di Serapide
Danny in pericolo viene salvato dall’intervento di Reece.Fabi autore del rapimento di Lexi , cerca di convincerla ad unirsi alla fratellanza per uccidere Farouk . I nazisti spostarono Cleopatra in una zona della Francia sotto il controllo del Reich. La Fratellanza cerca di trasportare l’artefatto altrove, ma viene smascherata.
Episodio 5
Il treno fantasma della Sierra Perdida
Lexi dopo aver incontrato Fabi continua a indagare sulla lettera del padre. Stando alle ultime informazioni Farouk si dovrebbe trovare in Serbia. Il terrorista parteciperebbe ad un’asta segreta con in palio i manufatti di Cleopatra.
Episodio 6
Fuga da Casablanca
Nel 1945, i nazisti sono approdati a Casablanca per un carico prezioso, ma vengono scoperti.Fabi nega a Lexi che il padre fosse della Fratellanza. Anche Carlo arriva a Casablanca per uccidere Danny , accusato della morte del figlio.
Episodio 7
Il portapranzo del destino
Danny una volta arrestato e tornato a Roma , convince l’agente federale Harper di collaborare. Lui trovera dieci quadri che mancano all’appello, rubati da suo padre Patrick mentre l'agente troverà un fascicolo sui nazisti.
Episodio 8
L'ombra del progetto Atena
Danny e Lexi avvertomo Fabi prima che Gwen riesca ad arrestarlo. I due partono per la Polonia per cercare Moshe Cohen, un ex cacciatore nazista. I tre capiscono che Cleopatra potrebbe trovarsi in Quebec, ma Danny e Lexi vengono catturati da George Larose, un discendente dei nazisti che hanno provocato la distruzione della città nel ’45.
Episodio 9
Il prezzo della vendetta
Lexi e Danny consegnano alla Fratellanza il medaglione di Fabi con la cimice al suo interno, sperando in una collaborazione. Cosi si scopre che Farouk ha una parente in vita, gravemente malata in Moldavia. Creano una trappola per catturarlo ma riesce a fuggire lasciando il regalo per la ragazza che si rivela essere un ultimo indizio.
Episodio 10
Il ritorno della regina
Nel video del 1993 Sanchez da l'addio alla famiglia andando via con Cleoparta su un aereo.Gli uomini di Farouk continuano con il piano.
Episodio 11
Eredità del padre
Nell'appartamento di padre Chuck, Gwen informa tutti sulle scoperte su Zara Farouk : egiziana e morta per via di una micotossina. Danny chiama Simon chiedendo sulle intercettazioni , non ottiene nessun nuovo indizio. Dissidi tra Danny e Lexi sulla possibilità che Reece sia la mente di tutto , portano la squadra a dividersi in due con Lexi e Karlsson che indagano partendo da Ghezal , mentre Danny e Shaw indagano su Yates.
Episodio 12
La vendetta di Farouk
Lexi e Danny cercano di capire chi sia la mente criminale a capo delle operazioni. Grazie a Simon, scoprono anche l'esatta ubicazione del sarcofago di Antonio e Cleopatra...
