Episodio 1
Il Killer
L'ex caposquadra del FMI Jim Phelps ritorna quando il suo amico e protetto viene ucciso. Avrebbe saputo che il suo amico stava identificando un criminale esperto conosciuto solo con il nome Scorpio, così Scorpio ha mandato il suo assassino, un uomo con molti nomi che attualmente usa Matthew Drake, per prendersi cura di lui. La missione di Jim è interrompere il suo prossimo contratto e scoprire in qualche modo chi è lo Scorpione. Quindi Jim seleziona 4 membri del team, Nicholas Black, un maestro del travestimento, Casey Randall, uno stilista che si è unito al FMI per aiutare a catturare chi ha ucciso il suo fidanzato, Max Harte, un uomo che ha organizzato la sua missione per rintracciare suo fratello che è andato in MIA in Vietnam e Grant Collier, il figlio di uno dei vecchi membri del team di Jim, Barney Collier. Scoprono che Drake andrà a Londra, dove senza dubbio sarà il suo prossimo contratto...
Episodio 2
Colpo al casinò
Jim Phelps e il suo team di agenti hanno la missione di trovare le prove e le testimonianze necessarie per mettere definitivamente in prigione il famigerato capobanda del crimine Bob Connors, che è riuscito a sfuggire alla giustizia per più di 10 anni. L'unica persona che conosce abbastanza gli affari di Connor per fornire questa testimonianza è, tuttavia, un uomo che non parlerà mai: Frank Marley. Oltre ad essere amico intimo e pupillo di Connors, Marley, secondo quanto riferito, è segretamente preparato per conquistare l'impero commerciale di Connor quando alla fine andrà in pensione. La squadra decide di passare da Marley per cercare di rovinare la sua amicizia con Connors e, quindi, sciogliere la lingua a Marley.
Episodio 3
Fantasmi del passato
Jim Phelps e il suo team di agenti hanno la missione di estradare il colonnello Gregory Usher nel sistema legale degli Stati Uniti. Il colonnello Usher, autoproclamato presidente del suo paese, noto per la sua grande produzione di cocaina trasformata, è ricercato da tempo, ricercato per il suo esteso traffico di droga in tutto il mondo.
Episodio 4
La collana della zarina
Jim Phelps e il suo team di agenti ottengono la missione di liberare e cancellare il nome di un agente americano in pensione del FMI ingiustamente imprigionato per omicidio a Istanbul. Ora imminente l'esecuzione in Turchia, l'ex agente in questione sembra essere stato incastrato da un poliziotto corrotto di nome capitano Hamidou, che ha costruito tutta la sua carriera nelle forze di polizia con corruzione, omicidi e concussioni. Arrestando rapidamente in questo caso di omicidio, Hamidou si è guadagnato una grossa promozione. Un'altra svolta nel caso è che l'agente da soccorrere è il vecchio collega di Jim e il padre di Grant, Barney Collier...
Episodio 5
L'eredità
Prima che Hitler si togliesse la vita nel 1945, nascose un'enorme quantità di oro puro, derubato dalle chiese e dai castelli d'Europa. Hitler vedeva l'oro come un'eredità per la prossima generazione di nazisti, che sperava, con l'aiuto dell'oro, avrebbero potuto realizzare in futuro ciò che non era riuscito a fare. Affidò solo a quattro dei suoi ufficiali più stretti il segreto della posizione dell'oro. Nel corso degli anni, questi ufficiali hanno trasmesso il segreto ai loro figli e loro, a loro volta, lo hanno trasmesso ai loro. A più di 40 anni dalla fine della guerra, i nipoti - quattro persone cresciute in continenti diversi e quindi mai incontrate - sono pronti a raccogliere l'oro e con esso scatenare un'ondata di terrorismo con l'obiettivo finale di riportare il movimento nazista al potere. Jim Phelps e il suo team di agenti sono tuttavia vicini ai quattro nipoti, in missione per assicurarsi che il vecchio sogno di Hitler non si avveri mai.
Episodio 6
Il muro di Berlino
Jim Phelps e il suo team di agenti hanno la missione di distruggere l'operazione di mercato nero del dottor Gerstner, che, negli anni '80 ha diviso Berlino, gestisce un servizio segreto che aiuta le persone nella Germania dell'Est a fuggire verso la parte occidentale in cambio di ingenti somme di denaro. La parte davvero subdola del suo servizio, tuttavia, è che le persone che accetta di aiutare non raggiungono mai l'ovest, visto che il suo socio in affari, il colonnello Batz, l'agente dei servizi segreti tedeschi, ha sempre soldati pronti ad arrestare i fuggitivi dall'altra parte. Nel corso degli anni, Gerstner e Batz hanno accumulato ingenti somme di denaro nei loro affari e hanno messo centinaia di uomini, donne e bambini in prigione o alle armi dei soldati...
Episodio 7
Contrabbando di armi
Jim Phelps e il suo team di agenti ottengono la missione di far fallire Douglas Matthews, allevatore di bestiame australiano, investitore e trafficante internazionale di armi per i terroristi. Il team del FMI, tuttavia, non è il solo a voler distruggere Matthews. Lo stesso vale per un gruppo di aborigeni australiani, infuriati dal fatto che Matthews abbia ucciso la loro gente e profanato le loro terre mentre trafficava armi.
Episodio 8
Scacco matto
Dopo la morte di sua moglie e l'omicidio di suo figlio, il professor Gregor Antonov, maestro di scacchi europeo e scienziato chiave in un importante progetto di difesa sovietico, è diventato sempre più deluso dal suo lavoro nella corsa agli armamenti della Guerra Fredda. Sconfortato, pensa di disertare verso l'ovest, dove vivrà una vita tranquilla insieme alla figlia quindicenne Sasha, l'unico membro della sua famiglia rimasto. I funzionari sovietici sono tuttavia ben consapevoli delle speranze di Antonov e quindi la sicurezza intorno a lui è rigorosa. Jim Phelps e la sua squadra di agenti sono assegnati alla missione di portare Antonov e sua figlia fuori dall'Unione Sovietica e portarli al sicuro in Occidente. L'occasione perfetta per farlo sembra essere durante un torneo di scacchi in Cecoslovacchia, al quale parteciperà il maestro di scacchi Antonov.
Episodio 9
Ritorno dall'aldilà
Mentre studia all'Università di Honolulu, la principessa Jehan, figlia di un ricco barone del petrolio dell'Europa orientale, scompare misteriosamente. Sebbene il suo corpo non sia mai stato ritrovato, tutti i segni indicano un omicidio e una morte molto violenta. Pur non producendo alcuna prova, la polizia è convinta che l'assassino della principessa sia Champ Foster, un uomo di una ricca e influente famiglia hawaiana. Credono che sia responsabile di almeno una mezza dozzina di altri omicidi negli Stati Uniti, ma i soldi e l'influenza della sua famiglia hanno letteralmente permesso al signor Foster di cavarsela con gli omicidi per anni. Jim Phelps e il suo team di agenti hanno la missione di scoprire se Champ Foster ha davvero ucciso la principessa Jehan e, in caso affermativo, di trovare quella prova cruciale.
Episodio 10
I leoni di Bajan-Du
Poiché il re del paese di Bajan-Du muore improvvisamente, ci si aspetta che il suo giovane figlio, il principe Mikos, continui il lavoro di suo padre e prenda il posto di suo padre sul trono. Tuttavia, secondo la tradizione Bajan-Du, nessuno può essere re del paese senza prima aver superato «la cerimonia dei leoni dorati», una cerimonia che il fratello del defunto re Ki è determinato a fissare in modo che il principe non abbia alcuna possibilità di risolverla. Vuole che il Principe muoia cercando di trovare la risposta al rompicapo. Ki, che è il prossimo in fila al trono, spera di governare da allora in poi Bajan-Du e porre immediatamente fine a tutta la modernizzazione e le influenze occidentali che il suo defunto fratello era così determinato a portare nel loro antico paese. Jim Phelps e il suo team di agenti hanno la missione di salvare la vita del principe Mikos e rovinare tutti i piani di Ki.
Episodio 11
Il greco
Jim Phelps e il suo team di agenti sono assegnati alla missione di smantellare una rete internazionale di distribuzione di farmaci gestita da Socrates Colonnades. In primo luogo, devono porre fine al modo in cui Colonnades si procura i farmaci che distribuisce. Colonnades ci riesce rubando alle organizzazioni umanitarie forniture mediche destinate ai paesi del terzo mondo.
Episodio 12
Asilo politico
Mentre il dittatore Luis Berezan cominciava a indebolirsi sempre più a causa della vecchiaia e delle malattie, la gente del suo paese di Alcante ha finalmente ritenuto opportuno iniziare una tanto attesa rivoluzione contro il suo regime. Luis Berezan e sua moglie Emelia sono fuggiti dal Paese - non senza però aver prima svuotato il tesoro di Alcante - e hanno chiesto asilo negli Stati Uniti. Negli Stati Uniti vivono nel lusso, mentre le persone del paese in bancarotta che hanno lasciato muoiono di fame. Jim Phelps e il suo team di agenti ottengono l'incarico di localizzare e rubare il denaro originariamente rubato dai Berezan, con lo scopo di restituirlo agli abitanti di Alcante.
Episodio 13
Il grande ricattatore
La sua lunga carriera come editorialista ed emittente di successo a Washington ha fornito ad Arthur Six molte informazioni sensibili su persone importanti nel mondo della politica, del diritto e degli affari. Queste informazioni vengono poi utilizzate da Six a scopo di ricatto, portandolo a controllare un certo numero di uomini e donne in posizioni molto alte. Il suo principale avversario in questo momento è il senatore Tom Oxenford, che vuole che Six venga incriminato da un gran giurì per essere coinvolto in una cospirazione di ricatto contro il governo americano. Jim Phelps e il suo team di agenti hanno il compito di accertarsi che Six sia davvero incriminato dalla giuria e di trovare e cancellare i suoi registri segreti di ricatti.
Episodio 14
Guerra chimica
Jim e il suo team del FMI vengono inviati a localizzare e distruggere un impianto in cui vengono prodotte armi chimiche. E l'uomo dietro, Christie, è un agente canaglia dell'MI6. Uno scienziato russo li accompagna per aiutarli. Jim va a incontrare Christie con il pretesto di essere un commerciante di diamanti che sta acquistando i diamanti che sta vendendo per finanziare la sua operazione. Ma Christie, dopo aver saputo chi è Jim, cerca di ucciderlo ma Max lo salva. Prendono i diamanti. Ma in seguito scoprono che otterrà ancora il suo finanziamento, quindi Jim decide di restituirgli i diamanti nella speranza che abbassi la guardia in modo che possano fermarlo.
Episodio 15
I diavoli
Poco dopo aver soggiornato come ospiti nella tenuta di campagna inglese di Lord Holman, terzo barone di Saffron Cobden e membro della Camera dei Lord inglese, due diplomatici occidentali si sono suicidati. Un altro diplomatico, anch'egli assiduo ospite di Lord Holman, è stato ricoverato in un istituto per pazzi mentali. Allo stesso tempo, i corpi di tre ragazze sono stati trovati pugnalati a morte in un fiume vicino alla tenuta di Holman. Jim Phelps e il suo team di agenti hanno la missione di indagare su questi misteriosi eventi, di scoprire se c'è qualche legame tra le ragazze morte e i suicidi, oltre a scoprire cosa combinano realmente Lord Holman e i suoi ospiti nella villa di campagna.
Episodio 16
Il virus
Jim Phelps e il suo team di agenti sono assegnati alla missione di trovare e neutralizzare un pericoloso batterio rubato chiamato Xerxes, che, se esposto, contribuirà rapidamente all'invecchiamento di tutti gli organi vitali dell'essere umano. Si ritiene che il batterio sia stato rubato da Catherine Balzac, che, oltre a gestire un night club parigino, traffica informazioni sul mercato nero.
Episodio 17
La vendetta
Quando l'ex agente del FMI Laura Ann Wilson viene uccisa, le impronte digitali di Jim Phelps vengono trovate sulla scena del crimine, rendendolo il principale sospettato della polizia nel caso. Sapendo tuttavia che Phelps si trovava in Thailandia al momento dell'omicidio per lavorare su un caso, il segretario del FMI si rende conto che Phelps deve essere stato incastrato da qualcuno. Jim identifica il suo ex collega agente Russell Acker come l'unica persona che potrebbe essere responsabile. Dopo aver avuto un grave incidente stradale 14 anni fa, Acker è impazzito e ha iniziato a uccidere belle donne. Jim Phelps, Laura Ann Wilson e altre due agenti donne alla fine lo hanno rinchiuso a vita in un istituto psichiatrico. Acker considerava l'essere scoperto dai suoi colleghi come il tradimento definitivo e ora deve aver finalmente trovato un modo per riprendersi dall'interno della sua prigione di massima sicurezza per pazzi di mente.
Episodio 18
Mercanti d'armi
Il sottomarino americano USS Concorde è drammaticamente perso in mare e i pochi membri dell'equipaggio sopravvissuti riferiscono che il sottomarino è stato distrutto da un siluro contenente un sofisticato virus informatico. Questo virus ha distrutto il sistema informatico del sottomarino, rendendo impossibile il controllo della nave sottomarina. Jim Phelps e il suo team di agenti hanno la missione di trovare il programma antivirus che ha fatto affondare il Concorde, in modo da poter creare un programma antidoto. Devono trovare i creatori del virus e metterli fuori dal virus creando affari per sempre.
Episodio 19
Zombi
Jim Phelps e il suo team di agenti sono incaricati di scoprire cosa è successo a più di 100 ragazze misteriosamente scomparse dalla città americana di New Orleans. La polizia di New Orleans è convinta che le ragazze siano state vittime di Jake Morgan, proprietario di un jazz club che ritengono anche responsabile di una vasta attività di schiavitù bianca che rapisce ragazzine e le vende come schiave in paesi dell'Africa e dell'Asia. Se Morgan è davvero colpevole di queste accuse, spetta al team del FMI trovare le prove e, si spera, anche un registro completo di tutte le ragazze che sono state vendute attraverso l'organizzazione. Se si riescono a trovare i documenti, le ragazze in questione possono essere rintracciate e, si spera, alla fine anche salvate dalla schiavitù.
